На мой взгляд, САИ в чем-то гораздо лучше фотошопа и удобнее. Линии в нем, например, всегда выходят прямыми, даже если рисуешь при большом масштабировании. Еще он позволяет при раскраске смешивать цвет, из-за чего переходы между светом и тенью выглядят более мягко. Однако надо признать, что в ФШ гораздо больше опций по обработке изображения, чем в САИ — в частности, в САИ очень муторно кадрировать рисунок. Лично я, например, предпочитаю всю работу сделать в САИ, а потом в ФШ отредактировать.
В Sai удобные настройки кисти. Удобнее и обводить, за счет сглаживания дрожания руки, и красить — сглаживание наношения краски толстой кистью. Фотошоп попросту через определенные интервалы рисует кружок с радиусом, считанным с силы нажатия пера, так что, как ни старайся будет всё в итоге выглядеть как грубая пластилиновая фигурка. А в сае такой тотальной кружковатости нет: там не просто ставят кружочки через определенные участки по мере движения пера, но еще и забивают промежутки между ними средним арифметическим из двух соседних.